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线性富集 LinEnrich™

面向宏基因组的目标区域定量技术。在微生物组研究中,真正与表型相关的功能基因往往只占极小比例;线性富集让研究者只测所需的,告别高成本的全基因组测序。

01 / 问题

人体基因组 vs 微生物组

功能基因在微生物组中丰度各异,其中与表型相关者往往极其稀少——这正是传统全基因组测序浪费成本的根源。

人体基因组:约 19,000 条基因,传统研究更关注测序精度而非基因定量。
微生物组:数千亿微生物细胞、多达 900 万个功能基因,且每种基因丰度不同。
02 / 成本结构

99.9% 的数据可能与你无关

900万
肠道微生物组功能基因
<1%
与特定表型相关的功能基因比例
99.9%
全基因组测序中的非目标数据

正常肠道微生物组包含数千亿微生物细胞、多达 900 万个功能基因,且每种基因丰度不同。与抑郁、肥胖、IBD 等表型相关的功能基因往往只占极小比例(小于总序列读长的 1%)。在无关序列上投入的大量成本,导致了冗长的研究设计与居高不下的商业检测成本。

03 / 方法学

传统方法为何不适用

探针测序方法

目标丰度的测定会受对应探针数量的影响,无法如实反映原始丰度,因此不适用于宏基因组的目标定量。

PCR 测序方法

PCR 循环中聚合酶的干扰会改变目标序列的相对丰度,同样无法用于宏基因组的目标定量测序。

目前绝大多数靶向区域方法是为传统基因组学开发和优化的,缺乏保留序列丰度的能力,因此不能直接用于微生物组研究。

线性富集:保留丰度信息的目标定量

线性富集针对宏基因组设计,在富集目标区域的同时保持各目标序列的相对丰度信息,使研究者能够测量任意目标基因的丰度并加以储存。它帮助只需对个体微生物组特定序列进行定量分析的科研机构与商业检测公司,告别复杂高成本的全基因组测序。

  • 保留丰度
  • 覆盖目标区域
  • 降低测序成本
  • 适配宏基因组

典型应用

  • 疾病标志物与预测模型研究(如 2 型糖尿病预测模型)
  • 大规模队列研究中的目标基因定量
  • 商业检测中的低成本目标区域定量

线性富集:在富集目标区域的同时保留序列丰度信息

04 / 工作流程

从样本到目标区域定量

1

样本与文库

提取微生物组总 DNA,构建测序文库。

2

目标区域富集

按研究目标对特定功能基因/区域进行线性富集,保留原始丰度关系。

3

测序与定量

对富集产物测序,输出目标序列的定量结果。

4

分析与建模

结合知识库平台进行功能分析与预测建模。

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